L’Assemblée Générale est l’instance suprême de décision d'AUDICO. Elle définit la politique générale de l’ONG et élit le Président du Conseil d’Administration. Elle est qualifiée d’ordinaire ou d’extraordinaire suivant l’objet de ses délibérations. Elle se réunit pour décider des grandes orientations de l’ONG et veille à l’exécution des dispositions du statut de l’ONG. .
Le conseil d’administration est l’organe de veille et de contrôle de d'AUDICO il est investi de larges pouvoirs lui permettant de décider et d’autoriser toute opération Ayant pour but la réalisation de l’objet de l’ONG mais aussi d’assurer sa gestion, son Développement et son fonctionnement en restant fidèle à son éthique. Le conseil d’administration se réunit au moins deux fois dans l’année en séance ordinaire pour passer au peigne fin l’évolutions des activités .
Le commissariat aux comptes examine les comptes annuels et dressent un rapport spécial à l’Assemblée Générale assorti de leurs observations et propositions. .
La Direction exécutive est l'organe de gestion et d'administration de l’ONG. Il a pour Mission d'exécuter les décisions de l’Assemblée Générale et du conseil d’administration, de mettre en œuvre les programmes et projets de l’ONG.